Ничего там не долбанется. Конструкция "лентотяги" сидирома не позволит этому случится. Читаться должно нормально, если люфт у шинделя небольшой, ведь в перевернутом состоянии диск будет тянуть вниз и расстояние между линзой и диском увеличится.
Застрять, кстати, может, тем более вверх ногами. У меня когда-то вообще без диска лоток выехал, пришлось разбирать.
А насчет сом-порта, то напряжения там стандартные для TTL-логики "1"~2.5V, "0"~0.6V.