Грамотно написанному трояну никакие фаеры и антивирусы не помеха, если у владельца головы на плечах нет и он запускает всё подряд, что ему приходит по почте/аське/IRC.
Как чистить ручками не шибко крутые трояны и вирусы? Пуск-> Выполнить-> Автозагрузка и удаляём к чёртовой матери всё подозрительное. Как отличить подозрительное от не являющегося таковым? А вы сравните со списком установленной чистой винды + добавьте свой софт, который загружается при старте. Всё остальное - в топку. Со временем научитесь определять всякие C:\Windows\update1234.exe на ура без антивирусов.
Правда против маскирующихся вирусов, перехватывающих обращения к памяти, реестру и диску, удаляющих исполняемые файлы десятка известных антивирусов, а также блокирующих работу диспетчера задач и безопасный режим это не поможет. Тут уже копаться надо глубже =) Неблагодарная работа. Но и их удалить без переустановки системы - реально. Вопрос только в стоимости такой работы =)