С помощью настроек используемого браузера - поставить там связь..
Например, в опере это делается так:
Меню/настройки/общие - вкладка Расширенные, выбираем меню Программы и там добавляем протокол magnet и указываем путь к DC
Настройки uTorrent:
Вкладка Общие, снять галку с "проверять ассоциации при старте"
А в ДС в настройках, вкладка Дополнительно, поставить галку на "установить обработчик Magnet URL при запуске"